Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Годовая средняя температура в д. Агафоновка, на основе наблюдений, составляет 5.8°C. Месяц с самым низким температурным режимом — январь, его среднее значение температуры за день -13.7 °C. Месяц, когда зафиксированы самые высокие температуры - это июль с типичной температурой 27.4 °C. Температурный максимум, наблюдается в июле до 38.5°С, а минимум составляет -36.6°C в декабре. В течение одного календарного года: дни ясной погоды - 67, снегопадные дни - 84, дни с осадками - 112, пасмурных дней - 103.