Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Среднегодовая температура в п. Агние-Афанасьевск, исходя из данных наблюдений, достигает -0.8°C. Температурный максимум, замечается в июле до 29.2°С, а минимально может быть до -31.9°C в декабре. Месяц, когда зафиксированы самые низкие температуры — декабрь, его средний дневной температурный уровень -23.4 °C. Месяц, когда температура наиболее высокая — июль со среднеарифметической температурой 16.6 °C. В течение года: ясные дни - 86, снегопадные дни - 46, дни с дождем - 135, облачных дней - 99.