Климат (Cfb) умеренный океанический. Среднегодовая температура в Багратионовске, учитывая данные наблюдений, оценивается 12.1°C. Наиболее тёплый месяц - это август с характерной температурой 23.1 °C. Наихолоднейший месяц — январь, его средний дневной температурный уровень -1.2 °C. Самая высокая температура, регистрируется в августе до 34.9°С, минимальная достигает -16.4°C в январе. В течение одного календарного года: дни ясной погоды - 69, снежных дней - 50, дни с дождем - 155, пасмурных дней - 92.