Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Месяц с минимальными температурами — декабрь, его среднесуточная температура -5.8 °C. Месяц, когда зафиксированы самые высокие температуры — июль со средней температурой 21.7 °C. Годовая средняя температура в д. Большая Пустошка, в соответствии с наблюдениями, составляет 6.4°C. Самая высокая температура, проявляется в июле до 31.0°С, минимальная достигает -25.0°C в феврале. В течение года: дни ясной погоды - 62, дни со снегом - 75, дождливых дней - 156, пасмурных дней - 73.