Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Температурный максимум, устанавливается в августе до 34.6°С, а минимум составляет -31.6°C в декабре. Месяц с самыми низкими температурами — январь, характерная суточная температура -12.6 °C. Месяц с самым высоким температурным режимом — август со средней температурой 24.7 °C. Среднегодовая температура в с. Черки-Ишмяково, по данным наблюдений, составляет 8.1°C. В течение года: дни ясной погоды - 76, снегопадные дни - 74, дни с дождем - 116, облачных дней - 100.