Климат (Dfc) субарктический. Месяц с самыми низкими температурами — январь, его среднесуточная температура -30.0 °C. Месяц с самым высоким температурным режимом - это июль со среднеарифметической температурой 17.5 °C. Верхний предел температуры, проявляется в июле до 28.8°С, а наименьшая опускается до -46.1°C в январе. Среднегодовая температура в Хатангском с/с, на основе наблюдений, составляет -7.8°C. В течение года: солнечно-ясные дни - 78, дни снега - 120, дождливых дней - 75, пасмурных дней - 93.