Климат (Dfc) субарктический. Верхний предел температуры, проявляется в июне до 28.3°С, а наименьшая опускается до -33.3°C в январе. Средняя температура воздуха в Каргополе, учитывая данные наблюдений, оценивается 5.3°C. Месяц с минимальными температурами — январь, его характерная суточная температура -12.7 °C. Месяц, отмечающийся максимальными теплом - это июль со средним значением температуры 21.9 °C. В течение года: солнечных дней - 57, дни со снегом - 94, дни с осадками - 130, облачных дней - 85.