Климат (Dfc) субарктический. Верхний предел температуры, проявляется в августе до 29.7°С, а наименьшая опускается до -33.3°C в январе. Средняя температура воздуха в Каргополе, учитывая данные наблюдений, оценивается 5.0°C. Месяц с минимальными температурами — январь, его характерная суточная температура -12.7 °C. Месяц, отмечающийся максимальными теплом - это август со средним значением температуры 20.5 °C. В течение года: солнечных дней - 50, дни со снегом - 99, дни с осадками - 109, облачных дней - 108.