Климат (Dfc) субарктический. Средняя температура за год в Кондопоге, принимая во внимание наблюдения, оценивается 4.5°C. Месяц, когда температура наиболее низкая — январь, его суточный температурный средний показатель -12.8 °C. Месяц, отмечающийся максимальными теплом — август со средней температурой 19.7 °C. Температурный максимум, отмечается в августе до 28.0°С, а порог минимальной температуры до -36.2°C в январе. За период года: солнечно-ясные дни - 58, дни со снегом - 102, дни с дождем - 118, пасмурных дней - 88.