Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Среднегодовая температура в п. Кызыкульский, основываясь на наблюдениях, оценивается 8.3°C. Наивысшая температура, устанавливается в июне до 40.6°С, а низшая понижается до -30.8°C в январе. Месяц, когда температура наиболее низкая — январь, его среднее суточное значение температуры -13.1 °C. Наитеплейший месяц — июль со среднеарифметической температурой 29.9 °C. В течение одного календарного года: солнечных дней - 76, снегопадные дни - 53, дни с осадками - 136, пасмурных дней - 101.