Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Средняя температура за год в с. Кызыл-Яр, согласно наблюдениям, составляет 6.3°C. Температурный максимум, регистрируется в августе до 32.7°С, а наименьшая опускается до -34.1°C в январе. Месяц с самыми высокими температурами - это август с типичной температурой 23.2 °C. Месяц, когда температура наиболее низкая — январь, среднесуточная температура -14.6 °C. На протяжении года: солнечных дней - 72, снежных дней - 74, дни с дождем - 125, пасмурных дней - 95.