Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Самая высокая температура, фиксируется в июле до 35.0°С, минимальная достигает -30.0°C в январе. Месяц, когда температура наиболее низкая — январь, типичное среднесуточное температурное значение -11.6 °C. Месяц, когда температура наиболее высокая — июль со средним значением температуры 25.2 °C. Годовая средняя температура в Льнозаводе, по данным наблюдений, оценивается 8.7°C. В рамках года: дни ясной погоды - 72, снегопадные дни - 85, дождливых дней - 123, облачных дней - 86.