Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Максимальная температура, фиксируется в июле до 31.4°С, минимальная достигает -30.1°C в январе. Самый тёплый месяц - это июль с характерной температурой 21.5 °C. Наихолоднейший месяц — январь, его типичное среднесуточное температурное значение -13.6 °C. Среднегодовая температура в д. Малое Яндуганово, исходя из наблюдений, составляет 5.7°C. За год: ясные дни - 82, снегопадные дни - 65, дни с дождем - 151, облачных дней - 68.