Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Наитеплейший месяц - это июль со средним значением температуры 25.5 °C. Месяц с самыми низкими температурами — январь, суточный температурный средний показатель -11.1 °C. Самая высокая температура, проявляется в июле до 40.1°С, а низшая понижается до -30.9°C в декабре. Средняя температура за год в Малоенисейском с/с, исходя из данных наблюдений, достигает 8.1°C. В течение одного календарного года: солнечно-ясные дни - 69, дни снега - 79, дни с осадками - 123, облачных дней - 95.