Климат (Dfc) субарктический. Наиболее тёплый месяц — июль со средним значением температуры 23.9 °C. Месяц, когда зафиксированы самые низкие температуры — декабрь, типичное среднесуточное температурное значение -16.7 °C. Наивысшая температура, наблюдается в июне до 33.6°С, а низшая понижается до -42.8°C в декабре. Средняя температура воздуха в п. Малый Кайдат, по данным наблюдений, оценивается 3.2°C. За период года: дни ясной погоды - 70, дни снега - 109, дни с дождем - 125, облачных дней - 62.