Климат (BSk) холодный полуаридный (степной). Годовая средняя температура в Манасе, на основе наблюдений, составляет 16.5°C. Месяц с минимальными температурами — январь, его типичное среднесуточное температурное значение 4.6 °C. Месяц, когда зафиксированы самые высокие температуры - это август с типичной температурой 29.3 °C. Температурный максимум, устанавливается в июле до 35.8°С, а минимально может быть до -4.8°C в январе. В пределах года: ясные дни - 135, дни снега - 10, дождливых дней - 119, пасмурных дней - 102.