Климат (Dfc) субарктический. Наихолоднейший месяц — декабрь, его суточный температурный средний показатель -24.5 °C. Месяц, когда температура наиболее высокая — июль с привычной температурой 16.4 °C. Годовая средняя температура в п. Мессояха, на основе наблюдений, достигает -6.1°C. Верхний предел температуры, фиксируется в июле до 28.4°С, а минимум составляет -41.0°C в феврале. В течение года: ясные дни - 50, снегопадные дни - 152, дни с осадками - 74, облачных дней - 90.