Климат (Dfc) субарктический. Среднегодовая температура в д. Никонова Губа, в соответствии с наблюдениями, составляет 5.2°C. Месяц, отмечающийся максимальными теплом — август со средним значением температуры 20.2 °C. Месяц с минимальными температурами — январь, его среднее суточное значение температуры -12.5 °C. Вершина температурного диапазона, отмечается в августе до 28.5°С, минимальная достигает -33.3°C в январе. На протяжении года: дни ясной погоды - 55, дни снега - 100, дни с осадками - 116, облачных дней - 95.