Климат (Dwc) муссонный субарктический. Наитеплейший месяц — июль со среднеарифметической температурой 30.1 °C. Самый холодный месяц — январь, суточный температурный средний показатель -17.3 °C. Максимальная температура, устанавливается в июле до 34.7°С, а самая низкая до -32.9°C в феврале. Среднегодовая температура в с. Нижний Саянтуй, учитывая данные наблюдений, достигает 6.0°C. На протяжении года: солнечных дней - 113, снежных дней - 58, дни с дождем - 106, пасмурных дней - 89.