Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Месяц с минимальными температурами — январь, его среднесуточная температура -13.5 °C. Месяц с самыми высокими температурами - это август со среднеарифметической температурой 21.9 °C. Среднегодовая температура в с. Пертнуры, принимая во внимание наблюдения, составляет 6.4°C. Верхний предел температуры, фиксируется в июле до 32.1°С, а низшая понижается до -31.7°C в декабре. В пределах года: солнечных дней - 64, дни со снегом - 73, дни с дождем - 119, пасмурных дней - 110.