Климат (Cfb) умеренный океанический. Месяц с самым низким температурным режимом — май, средний дневной температурный уровень 20.6 °C. Месяц, когда зафиксированы самые высокие температуры - это сентябрь со средним значением температуры 26.2 °C. Самая высокая температура, проявляется в апреле до 29.8°С, а низшая понижается до 11.8°C в августе. Средняя температура за год в Попаяне, в соответствии с наблюдениями, оценивается 23.4°C. В рамках года: дни ясной погоды - 11, дни снега - 0, дождливых дней - 344, пасмурных дней - 11.