Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Наивысшая температура, фиксируется в августе до 31.0°С, а порог минимальной температуры до -30.3°C в январе. Месяц, отмечающийся максимальными теплом - это август с типичной температурой 23.9 °C. Самый холодный месяц — январь, его типичное среднесуточное температурное значение -9.7 °C. Средняя температура за год в с. Пущино, исходя из наблюдений, достигает 7.6°C. В пределах года: ясные дни - 84, снегопадные дни - 67, дни с осадками - 131, пасмурных дней - 84.