Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Самый холодный месяц — январь, его суточный температурный средний показатель -11.2 °C. Самый тёплый месяц — июль с характерной температурой 21.9 °C. Среднегодовая температура в с. Пустынь, в соответствии с наблюдениями, достигает 7.2°C. Вершина температурного диапазона, устанавливается в июне до 30.3°С, а самая низкая до -28.1°C в январе. За период года: ясные дни - 83, снежных дней - 68, дни с осадками - 133, облачных дней - 82.