Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Среднегодовая температура в д. Пустынь, по данным наблюдений, составляет 9.0°C. Наиболее тёплый месяц - это август со средней температурой 24.8 °C. Месяц с самыми низкими температурами — январь, суточный температурный средний показатель -10.3 °C. Температурный максимум, отмечается в июле до 33.7°С, а порог минимальной температуры до -26.4°C в январе. За период года: солнечных дней - 60, снежных дней - 78, дни с дождем - 136, облачных дней - 92.