Климат (Dfc) субарктический. Средняя температура за год в д. Пустынь, исходя из наблюдений, составляет 3.2°C. Верхний предел температуры, замечается в июле до 29.4°С, а самая низкая до -33.3°C в январе. Месяц, отмечающийся максимальными теплом — июль с привычной температурой 18.7 °C. Месяц с самым низким температурным режимом — январь, его среднесуточная температура -15.0 °C. В течение одного календарного года: дни ясной погоды - 44, снежных дней - 98, дни с осадками - 117, облачных дней - 107.