Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Среднегодовая температура в д. Пустыня, в соответствии с наблюдениями, оценивается 8.9°C. Максимальная температура, замечается в августе до 32.7°С, минимальная достигает -27.7°C в январе. Месяц, когда зафиксированы самые низкие температуры — январь, среднее суточное значение температуры -7.5 °C. Месяц с самыми высокими температурами - это август со среднеарифметической температурой 23.6 °C. На протяжении года: дни ясной погоды - 69, дни снега - 72, дни с осадками - 135, облачных дней - 90.