Климат (BSk) холодный полуаридный (степной). Среднегодовая температура в с. Шекпээр, учитывая данные наблюдений, достигает 2.9°C. Максимальная температура, проявляется в июле до 33.6°С, а самая низкая до -38.0°C в декабре. Месяц с самыми низкими температурами — январь, его характерная суточная температура -21.2 °C. Месяц с максимальными температурами — июль со среднеарифметической температурой 24.1 °C. За период года: ясные дни - 76, дни со снегом - 44, дни с дождем - 120, облачных дней - 126.