Климат (Dfc) субарктический. Наивысшая температура, отмечается в июле до 29.5°С, а низшая понижается до -36.2°C в январе. Месяц, когда температура наиболее низкая — январь, его средний дневной температурный уровень -14.4 °C. Месяц с самыми высокими температурами — июль со средним значением температуры 21.7 °C. Средняя температура воздуха в Шенкурском р-н, исходя из данных наблюдений, составляет 4.5°C. В течение одного календарного года: ясные дни - 61, снегопадные дни - 95, дни с дождем - 134, пасмурных дней - 76.