Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Наивысшая температура, проявляется в июле до 34.8°С, а порог минимальной температуры до -38.6°C в январе. Месяц с минимальными температурами — январь, его среднее значение температуры за день -16.1 °C. Самый тёплый месяц — июль со средней температурой 23.1 °C. Годовая средняя температура в с. Шишкина, учитывая данные наблюдений, составляет 3.9°C. В течение одного календарного года: солнечных дней - 63, дни со снегом - 92, дни с осадками - 105, пасмурных дней - 106.