Климат (Dwc) муссонный субарктический. Наивысшая температура, наблюдается в июле до 37.7°С, а низшая понижается до -31.8°C в январе. Месяц с минимальными температурами — декабрь, его среднесуточная температура -14.5 °C. Месяц с максимальными температурами - это август с привычной температурой 21.2 °C. Среднегодовая температура в с. Средний Шергольджин, на основе наблюдений, оценивается 4.3°C. За период года: дни ясной погоды - 87, снегопадные дни - 60, дни с осадками - 111, пасмурных дней - 108.