Климат (Dwc) муссонный субарктический. Наивысшая температура, наблюдается в июле до 37.7°С, а низшая понижается до -31.8°C в январе. Месяц с минимальными температурами — декабрь, его среднесуточная температура -14.5 °C. Месяц с максимальными температурами - это июль с привычной температурой 23.4 °C. Среднегодовая температура в с. Средний Шергольджин, на основе наблюдений, оценивается 4.5°C. За период года: дни ясной погоды - 85, снегопадные дни - 60, дни с осадками - 109, пасмурных дней - 112.