Климат (BSk) холодный полуаридный (степной). Наитеплейший месяц — июль с типичной температурой 35.5 °C. Наихолоднейший месяц — декабрь, его среднесуточная температура 1.3 °C. Среднегодовая температура в Ташкургане, согласно наблюдениям, составляет 19.7°C. Верхний предел температуры, фиксируется в августе до 43.0°С, а самая низкая до -5.4°C в марте. В течение года: ясные дни - 249, дни со снегом - 10, дождливых дней - 75, пасмурных дней - 32.