Климат (BSk) холодный полуаридный (степной). Наитеплейший месяц — июль с типичной температурой 35.1 °C. Наихолоднейший месяц — февраль, его среднесуточная температура 9.0 °C. Среднегодовая температура в Ташкургане, согласно наблюдениям, составляет 22.4°C. Верхний предел температуры, фиксируется в июне до 41.8°С, а самая низкая до -5.4°C в марте. В течение года: ясные дни - 243, дни со снегом - 9, дождливых дней - 65, пасмурных дней - 49.