Климат (BSk) холодный полуаридный (степной). Верхний предел температуры, наблюдается в августе до 41.6°С, а минимальный уровень достигает -14.9°C в январе. Месяц с самым низким температурным режимом — январь, его суточный температурный средний показатель -1.3 °C. Месяц с самыми высокими температурами - это август с типичной температурой 30.9 °C. Среднегодовая температура в с. Три Протока, учитывая данные наблюдений, достигает 15.6°C. В пределах года: дни ясной погоды - 160, снегопадные дни - 23, дни с дождем - 69, облачных дней - 114.