Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Годовая средняя температура в с. Усть-Кишерть, в соответствии с наблюдениями, составляет 4.3°C. Самый холодный месяц — январь, его среднесуточная температура -14.1 °C. Месяц, когда зафиксированы самые высокие температуры — июль с характерной температурой 21.6 °C. Наивысшая температура, устанавливается в июле до 32.6°С, а минимум составляет -35.7°C в декабре. За год: солнечно-ясные дни - 62, дни снега - 89, дождливых дней - 145, облачных дней - 70.