Климат (Dfc) субарктический. Наихолоднейший месяц — декабрь, его суточный температурный средний показатель -6.2 °C. Наитеплейший месяц — июль со среднеарифметической температурой 23.4 °C. Вершина температурного диапазона, отмечается в июле до 33.0°С, а минимальный уровень достигает -24.1°C в декабре. Годовая средняя температура в Верхе-Апшуяхтинском с/п, исходя из данных наблюдений, составляет 8.7°C. В пределах года: солнечных дней - 74, снежных дней - 70, дни с осадками - 122, облачных дней - 100.