Климат (Dfc) субарктический. Месяц, когда зафиксированы самые низкие температуры — январь, его типичное среднесуточное температурное значение -29.1 °C. Месяц с самыми высокими температурами - это июнь с типичной температурой 18.9 °C. Годовая средняя температура в п. Верхний Балыгычан, исходя из наблюдений, составляет -5.4°C. Вершина температурного диапазона, устанавливается в июне до 30.2°С, минимальная достигает -40.9°C в феврале. На протяжении года: ясные дни - 70, снежных дней - 107, дни с дождем - 48, облачных дней - 141.