Климат (Cfa) влажный субтропический. Самая высокая температура, устанавливается в августе до 34.6°С, а низшая понижается до -11.0°C в январе. Месяц с самыми низкими температурами — январь, его суточный температурный средний показатель 3.3 °C. Месяц, отмечающийся максимальными теплом - это июль с характерной температурой 24.4 °C. Среднегодовая температура в с. Водопойное, по данным наблюдений, составляет 13.7°C. За год: солнечных дней - 173, снегопадные дни - 12, дни с дождем - 123, пасмурных дней - 58.