Климат (Dfb) влажный континентальный с теплым летом. Самая высокая температура, регистрируется в июле до 34.6°С, а минимальный уровень достигает -29.2°C в декабре. Среднегодовая температура в д. Запольные Пертнуры, исходя из наблюдений, составляет 8.9°C. Месяц с самыми низкими температурами — январь, его среднее суточное значение температуры -11.0 °C. Месяц с самыми высокими температурами - это август со средним значением температуры 24.4 °C. За период года: солнечных дней - 65, дни со снегом - 73, дождливых дней - 119, пасмурных дней - 109.